为什么 AlphaFold 尚未解决蛋白质折叠问题:Pushmeet Kohli 与 Sal Candido 谈 AI 生物学
Google DeepMind 的 Pushmeet Kohli 与 Biohub 的 Sal Candido 认为,AlphaFold 推动了蛋白质结构预测,但并未解决蛋白质的动态变化、无序状态及更广泛的生物学问题。他们讨论了如何寻找适用于生物数据的 scaling law、平衡数据生成与模型设计,以及从单个蛋白质模型迈向更大生物系统建模。
技术方向
训练侧的门道:数据集构建、合成数据、预训练与后训练方法、算力与训练成本。
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Google DeepMind 的 Pushmeet Kohli 与 Biohub 的 Sal Candido 认为,AlphaFold 推动了蛋白质结构预测,但并未解决蛋白质的动态变化、无序状态及更广泛的生物学问题。他们讨论了如何寻找适用于生物数据的 scaling law、平衡数据生成与模型设计,以及从单个蛋白质模型迈向更大生物系统建模。
乌克兰无人机于 10 月 8 日和 9 日袭击俄罗斯科技公司 Yandex 在萨索沃和卡卢加的两座数据中心,五座数据中心中有两座瘫痪,影响其 AI 聊天机器人及其他在线服务。萨索沃设施内有用于训练 YandexGPT 的三台超级计算机中的两台;Yandex 表示无人受伤,但部分服务受到干扰。
文章梳理腾讯、阿里、字节和DeepSeek为AI扩张融资或筹资的安排,并指出这些资金将用于基础设施、数据中心和算力供给。阿里以配售融资800亿港元,字节签下296亿美元贷款,腾讯考虑发行最高50亿美元离岸债券,DeepSeek新一轮融资预计超过800亿元。文章认为,提前建设和锁定算力会带来持续投入,最终还款与折旧压力仍取决于企业客户订单能否覆盖成本。
Periodic Labs 的 Liam Fedus 和 Ekin Dogus Cubuk 探讨如何让 AI 通过真实物理实验发现新材料,并提出“合成超级智能”愿景。团队结合强化学习、模拟、高通量实验和材料表征,让模型从科学研究全过程及失败实验中学习;他们认为,即使是前沿模型,仍需通过实验检验猜想。
硅谷101访谈Scale AI后训练与评测研究负责人何允中、伯克利博士后孙一铀,讨论AI数据行业从人工标注转向rubric、RL环境和智能体数据。对话提到AfterQuery估值从今年4月A轮的3亿美元升至9月新一轮融资后的32亿美元,Bespoke Labs种子轮与A轮融资合计4000万美元。
Tech星球梳理称,刘大一恒、陈宇森、罗福莉、周畅、姚顺雨等90后正在接手国产大模型关键岗位,分别覆盖Qwen、千问办公、MiMo、字节多模态和腾讯大语言模型及AI Infra。文章列举了他们在开源模型、多模态生成、AI Agent、基础模型和办公智能体商业化中的履历与近期成绩。作者认为,职位交接已经发生,但这些团队仍要面对能力上限、成本约束、商业化落地、组织整合和持续追赶等考验。
Zuckerberg 和 Priscilla Chan 支持的非营利组织 Biohub 正协调一项 $1.8 billion 计划,用于建设可预测细胞行为的 AI 模型。
Microsoft Research Asia 发布并开源 Agent Lightning v1.0,一个约 3,500 行代码的轻量级 Agentic RL 框架,用于在真实 agent harness 中训练智能体。
推荐理由:原文展示了用真实 agent harness 参与 RL 训练的设计,可作为编码智能体训练流程的工程参考。
Google DeepMind、Meta 和 Isomorphic Labs 将共同向 Biohub 的 Virtual Biology 计划投资 $300 million,用于创建可帮助研究人员数字化提出、预测并回答生物学问题的 AI 数据集。
Hugging Face 介绍 Nemotron 团队从 Nemotron 3 出发,通过 SFT、RL 和反馈驱动推理,在 IOI 2026 与 IMO 2026 达到金牌水平。
推荐理由:文章同时给出训练数据、推理流程和开源入口,可参考其将基础模型专门化到竞赛任务的方法。
OpenAI 公开 722 篇数学手稿,全部出自一个尚未发布的内部模型,归成 372 组结果,并上传论文、源码和部分 Lean 证明到 GitHub。材料称这些结果覆盖准黎曼猜想、霍奇猜想、BSD猜想、π的无理性指数、唯一游戏猜想等 17 个方向,模型此前尝试约 4000 个研究问题,平均每项结果消耗约相当于 ChatGPT Pro 思考 3小时。
推荐理由:原文梳理了手稿覆盖范围、核验状态和数学界反应,可帮助理解AI产出数学成果后的同行消化压力。
Google Research 介绍了 Earth AI 的 Population Dynamics Foundation Model(PDFM)如何把地理空间嵌入接入公共卫生和流行病学工作流。
推荐理由:原文用五类公共卫生案例展示地理空间嵌入接入现有流行病学流程的效果。
NVIDIA 称电信运营商正把 AI 战略转向开放模型,以获得更高的信任、控制和定制能力,覆盖自主网络到客户服务等关键工作负载。其 State of AI in Telecommunications 报告显示,89% 受访者认为开源模型和软件对公司 AI 战略重要。
MIT Technology Review Insights 报告称,企业 AI 正从工具转向运营模型,需要把人员、流程和数据实时连接并纳入治理控制。全球 AI 投资预计在 2026 年达到 $2.5 trillion,较上一年增长 44%,但许多企业仍受数据孤岛和流程割裂限制;持续获得回报的企业先重设计流程,再选择模型,并建设可组合、主权可控的数据基础设施。
Asta 开源了 AstaBrief 8B,这是一个将研究问题和检索到的文献摘录转成带引用报告的开放权重模型。它已作为 Asta Generate a report 功能中的 Fast mode 提供,并与 Claude 驱动的 Thinking mode 并列;Asta 还开源训练数据,并发布可用自有 PDFs 生成报告的示例 workflow。
推荐理由:文章披露了训练数据筛选、DPO 构造和速度对比,适合参考科学报告生成模型的工程取舍。
Google Research 宣布新一代基于 Trusted Execution Environments 的联邦学习系统,用于提供可验证、可审计的数据匿名化保证。
ServiceNow CoreAI 构建 AutoSynthData,用目标模型失败和更强教师模型成功案例生成企业智能体训练任务。它将任务抽象为 system specification、user prompt、verifier,并要求任务可行、真实、能暴露当前模型弱点;在 EnterpriseOps Gym 实验中,流程会验证任务并随模型改进调整课程。
Google DeepMind 推出 SynthID Bio,将水印技术用于合成生物学,在 AI 生成蛋白质序列和 3D 结构中嵌入可验证签名,同时在实验室测试中保持生物功能。
推荐理由:原文展示了生物设计水印在湿实验和结构预测中的验证结果,可用于理解 AI 生物安全的新防线。
Google Research 提出 Diffusion Controller 框架,将扩散模型去噪过程重构为连续控制问题,用轻量“steering damper”网络引导图像生成。实验使用 Stable Diffusion v1.4,并在 SFT、RWL、PPO 三种微调设置下以 HPS-v2 评估;完全解锁版本相对基线模型达到 90% 胜率。
Microsoft Research 介绍 Quine,这是一个研究项目,旨在构建生物学多模态世界模型,并用交互式 harness 连接模型、科学工具、文献和研究人员。
推荐理由:原文提供了 Quine 在肿瘤状态转移中的实验案例,可作为 AI 参与生物研究闭环的参考。